Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB2Q03252 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB2Q03252 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNB2Q03252 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms