Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACADSP16219 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACADSP16219 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSP16219 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSP16219 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSP16219 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSP16219 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACADSP16219 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSP16219 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSP16219 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSP16219 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSP16219 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSP16219 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACADSP16219 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSP16219 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSP16219 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSP16219 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSP16219 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSP16219 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSP16219 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSP16219 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSP16219 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSP16219 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACADSP16219 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSP16219 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSP16219 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSP16219 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSP16219 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSP16219 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSP16219 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSP16219 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACADSP16219 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSP16219 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSP16219 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSP16219 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSP16219 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSP16219 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSP16219 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSP16219 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACADSP16219 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSP16219 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSP16219 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACADSP16219 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ACADSP16219 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSP16219 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSP16219 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSP16219 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACADSP16219 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACADSP16219 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACADSP16219 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACADSP16219 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACADSP16219 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACADSP16219 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACADSP16219 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSP16219 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSP16219 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSP16219 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSP16219 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACADSP16219 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSP16219 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSP16219 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSP16219 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSP16219 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACADSP16219 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSP16219 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSP16219 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSP16219 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSP16219 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSP16219 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACADSP16219 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSP16219 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSP16219 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSP16219 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSP16219 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSP16219 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSP16219 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSP16219 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACADSP16219 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSP16219 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSP16219 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSP16219 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSP16219 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSP16219 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSP16219 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSP16219 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACADSP16219 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSP16219 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSP16219 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSP16219 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSP16219 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSP16219 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSP16219 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSP16219 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSP16219 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSP16219 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSP16219 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSP16219 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSP16219 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACADSP16219 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACADSP16219 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms