Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
N4BP1O75113 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
N4BP1O75113 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP1O75113 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
N4BP1O75113 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP1O75113 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP1O75113 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP1O75113 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms