Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRA1Q9HD15 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRA1Q9HD15 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRA1Q9HD15 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRA1Q9HD15 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms