Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4F12Q9HCS2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4F12Q9HCS2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4F12Q9HCS2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4F12Q9HCS2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4F12Q9HCS2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4F12Q9HCS2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP4F12Q9HCS2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP4F12Q9HCS2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP4F12Q9HCS2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4F12Q9HCS2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4F12Q9HCS2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4F12Q9HCS2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms