Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCX3BQ9H321 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VCX3BQ9H321 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCX3BQ9H321 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms