Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD2AQ9BW72 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD2AQ9BW72 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD2AQ9BW72 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms