Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VSIG2Q96IQ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VSIG2Q96IQ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSIG2Q96IQ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms