Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNE3Q6ZMZ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNE3Q6ZMZ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNE3Q6ZMZ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNE3Q6ZMZ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNE3Q6ZMZ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNE3Q6ZMZ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNE3Q6ZMZ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNE3Q6ZMZ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNE3Q6ZMZ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYNE3Q6ZMZ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNE3Q6ZMZ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNE3Q6ZMZ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYNE3Q6ZMZ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYNE3Q6ZMZ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms