Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE1CQ14123 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDE1CQ14123 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE1CQ14123 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1CQ14123 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms