Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATP11AP98196 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP11AP98196 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP11AP98196 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms