Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AIF1P55008 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AIF1P55008 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AIF1P55008 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AIF1P55008 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AIF1P55008 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AIF1P55008 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AIF1P55008 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AIF1P55008 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AIF1P55008 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AIF1P55008 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AIF1P55008 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AIF1P55008 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AIF1P55008 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AIF1P55008 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AIF1P55008 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AIF1P55008 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AIF1P55008 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AIF1P55008 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AIF1P55008 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AIF1P55008 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AIF1P55008 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AIF1P55008 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AIF1P55008 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AIF1P55008 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AIF1P55008 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AIF1P55008 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AIF1P55008 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AIF1P55008 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AIF1P55008 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AIF1P55008 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AIF1P55008 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AIF1P55008 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AIF1P55008 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AIF1P55008 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AIF1P55008 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AIF1P55008 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AIF1P55008 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AIF1P55008 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AIF1P55008 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AIF1P55008 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AIF1P55008 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AIF1P55008 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AIF1P55008 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AIF1P55008 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AIF1P55008 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AIF1P55008 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AIF1P55008 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AIF1P55008 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AIF1P55008 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AIF1P55008 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AIF1P55008 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AIF1P55008 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AIF1P55008 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AIF1P55008 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AIF1P55008 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AIF1P55008 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AIF1P55008 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AIF1P55008 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AIF1P55008 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AIF1P55008 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AIF1P55008 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AIF1P55008 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AIF1P55008 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AIF1P55008 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AIF1P55008 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AIF1P55008 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AIF1P55008 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AIF1P55008 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AIF1P55008 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AIF1P55008 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AIF1P55008 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AIF1P55008 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AIF1P55008 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AIF1P55008 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AIF1P55008 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AIF1P55008 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AIF1P55008 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AIF1P55008 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AIF1P55008 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AIF1P55008 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AIF1P55008 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AIF1P55008 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AIF1P55008 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AIF1P55008 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AIF1P55008 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AIF1P55008 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AIF1P55008 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AIF1P55008 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AIF1P55008 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AIF1P55008 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AIF1P55008 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AIF1P55008 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AIF1P55008 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AIF1P55008 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AIF1P55008 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AIF1P55008 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AIF1P55008 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AIF1P55008 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AIF1P55008 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms