Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN6P29350 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN6P29350 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN6P29350 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN6P29350 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms