Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBG1P23258 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms