Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NGFRP08138 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NGFRP08138 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NGFRP08138 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NGFRP08138 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NGFRP08138 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NGFRP08138 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NGFRP08138 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NGFRP08138 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NGFRP08138 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NGFRP08138 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NGFRP08138 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NGFRP08138 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NGFRP08138 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NGFRP08138 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NGFRP08138 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NGFRP08138 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NGFRP08138 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NGFRP08138 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NGFRP08138 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NGFRP08138 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NGFRP08138 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NGFRP08138 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NGFRP08138 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NGFRP08138 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NGFRP08138 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NGFRP08138 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NGFRP08138 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NGFRP08138 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NGFRP08138 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NGFRP08138 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NGFRP08138 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NGFRP08138 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NGFRP08138 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NGFRP08138 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NGFRP08138 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NGFRP08138 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NGFRP08138 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NGFRP08138 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NGFRP08138 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NGFRP08138 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NGFRP08138 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NGFRP08138 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NGFRP08138 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NGFRP08138 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NGFRP08138 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NGFRP08138 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NGFRP08138 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NGFRP08138 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NGFRP08138 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NGFRP08138 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NGFRP08138 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NGFRP08138 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NGFRP08138 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NGFRP08138 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NGFRP08138 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NGFRP08138 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NGFRP08138 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NGFRP08138 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NGFRP08138 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NGFRP08138 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NGFRP08138 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NGFRP08138 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NGFRP08138 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NGFRP08138 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NGFRP08138 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NGFRP08138 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NGFRP08138 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NGFRP08138 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NGFRP08138 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NGFRP08138 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NGFRP08138 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NGFRP08138 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NGFRP08138 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NGFRP08138 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NGFRP08138 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NGFRP08138 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NGFRP08138 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NGFRP08138 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NGFRP08138 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NGFRP08138 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NGFRP08138 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NGFRP08138 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NGFRP08138 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NGFRP08138 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NGFRP08138 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NGFRP08138 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NGFRP08138 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NGFRP08138 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NGFRP08138 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NGFRP08138 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NGFRP08138 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NGFRP08138 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NGFRP08138 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NGFRP08138 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NGFRP08138 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NGFRP08138 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NGFRP08138 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NGFRP08138 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NGFRP08138 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms