Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP3BO95985 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP3BO95985 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP3BO95985 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP3BO95985 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms