Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFPL2O75678 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFPL2O75678 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFPL2O75678 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1310.5 ms