Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3O43889 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3O43889 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3O43889 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3O43889 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3O43889 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3O43889 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3O43889 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3O43889 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3O43889 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3O43889 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3O43889 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3O43889 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3O43889 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3O43889 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3O43889 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3O43889 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CREB3O43889 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3O43889 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3O43889 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3O43889 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3O43889 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB3O43889 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB3O43889 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB3O43889 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3O43889 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3O43889 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3O43889 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3O43889 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB3O43889 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB3O43889 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB3O43889 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB3O43889 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB3O43889 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB3O43889 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB3O43889 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB3O43889 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB3O43889 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB3O43889 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB3O43889 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3O43889 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3O43889 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3O43889 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3O43889 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3O43889 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3O43889 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3O43889 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3O43889 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3O43889 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3O43889 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3O43889 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3O43889 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3O43889 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3O43889 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3O43889 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3O43889 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3O43889 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3O43889 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3O43889 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3O43889 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3O43889 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3O43889 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3O43889 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3O43889 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3O43889 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3O43889 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB3O43889 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB3O43889 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB3O43889 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB3O43889 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB3O43889 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB3O43889 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB3O43889 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CREB3O43889 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CREB3O43889 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3O43889 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3O43889 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3O43889 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3O43889 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3O43889 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3O43889 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3O43889 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3O43889 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3O43889 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3O43889 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3O43889 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREB3O43889 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREB3O43889 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREB3O43889 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREB3O43889 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREB3O43889 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREB3O43889 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3O43889 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3O43889 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3O43889 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3O43889 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3O43889 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3O43889 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3O43889 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3O43889 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms