Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CTDP1Q9Y5B0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CTDP1Q9Y5B0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTDP1Q9Y5B0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTDP1Q9Y5B0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTDP1Q9Y5B0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CTDP1Q9Y5B0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDP1Q9Y5B0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDP1Q9Y5B0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDP1Q9Y5B0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTDP1Q9Y5B0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDP1Q9Y5B0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDP1Q9Y5B0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDP1Q9Y5B0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDP1Q9Y5B0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTDP1Q9Y5B0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms