Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PLXND1Q9Y4D7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLXND1Q9Y4D7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXND1Q9Y4D7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXND1Q9Y4D7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms