Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYO6Q9UM54 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYO6Q9UM54 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYO6Q9UM54 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYO6Q9UM54 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYO6Q9UM54 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO6Q9UM54 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO6Q9UM54 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYO6Q9UM54 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms