Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDKN2AIPQ9NXV6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDKN2AIPQ9NXV6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDKN2AIPQ9NXV6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDKN2AIPQ9NXV6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDKN2AIPQ9NXV6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDKN2AIPQ9NXV6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDKN2AIPQ9NXV6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKN2AIPQ9NXV6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDKN2AIPQ9NXV6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDKN2AIPQ9NXV6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms