Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GINM1Q9NU53 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GINM1Q9NU53 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GINM1Q9NU53 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GINM1Q9NU53 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms