Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP29Q9HBJ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP29Q9HBJ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP29Q9HBJ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP29Q9HBJ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP29Q9HBJ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 248.5 ms