Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMG9Q9H0W8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMG9Q9H0W8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMG9Q9H0W8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMG9Q9H0W8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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