Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
VN1R3Q9BXE9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VN1R3Q9BXE9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VN1R3Q9BXE9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms