Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LARP6Q9BRS8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LARP6Q9BRS8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LARP6Q9BRS8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms