Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CITED2Q99967 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CITED2Q99967 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms