Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGBD4Q96DM1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGBD4Q96DM1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGBD4Q96DM1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms