Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3KBP1Q96B97 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3KBP1Q96B97 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms