Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET6

CHST13, Carbohydrate sulfotransferase 13, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST13Q8NET6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHST13Q8NET6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHST13Q8NET6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CHST13Q8NET6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHST13Q8NET6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms