Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC84Q86UT8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC84Q86UT8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC84Q86UT8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC84Q86UT8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms