Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR53Q7Z5U6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR53Q7Z5U6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR53Q7Z5U6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms