Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXX9

RSPO2, R-spondin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO2Q6UXX9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RSPO2Q6UXX9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RSPO2Q6UXX9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RSPO2Q6UXX9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RSPO2Q6UXX9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RSPO2Q6UXX9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPO2Q6UXX9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RSPO2Q6UXX9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPO2Q6UXX9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPO2Q6UXX9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPO2Q6UXX9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms