Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC62Q6P9F0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC62Q6P9F0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC62Q6P9F0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC62Q6P9F0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms