Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X3

TTC27, Tetratricopeptide repeat protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27Q6P3X3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TTC27Q6P3X3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC27Q6P3X3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC27Q6P3X3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC27Q6P3X3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC27Q6P3X3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC27Q6P3X3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC27Q6P3X3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC27Q6P3X3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC27Q6P3X3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC27Q6P3X3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC27Q6P3X3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC27Q6P3X3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC27Q6P3X3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms