Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIF1Q5T3J3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIF1Q5T3J3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIF1Q5T3J3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms