Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF1Q15637 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF1Q15637 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF1Q15637 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF1Q15637 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF1Q15637 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF1Q15637 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF1Q15637 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SF1Q15637 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF1Q15637 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF1Q15637 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF1Q15637 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SF1Q15637 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF1Q15637 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF1Q15637 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF1Q15637 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF1Q15637 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF1Q15637 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF1Q15637 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF1Q15637 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF1Q15637 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF1Q15637 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF1Q15637 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SF1Q15637 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SF1Q15637 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF1Q15637 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF1Q15637 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF1Q15637 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF1Q15637 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF1Q15637 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF1Q15637 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF1Q15637 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF1Q15637 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF1Q15637 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF1Q15637 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF1Q15637 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF1Q15637 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF1Q15637 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF1Q15637 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF1Q15637 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF1Q15637 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SF1Q15637 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF1Q15637 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF1Q15637 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF1Q15637 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF1Q15637 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF1Q15637 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF1Q15637 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SF1Q15637 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF1Q15637 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF1Q15637 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF1Q15637 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF1Q15637 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF1Q15637 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SF1Q15637 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF1Q15637 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SF1Q15637 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF1Q15637 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF1Q15637 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SF1Q15637 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF1Q15637 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF1Q15637 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF1Q15637 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF1Q15637 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF1Q15637 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF1Q15637 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF1Q15637 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SF1Q15637 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF1Q15637 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF1Q15637 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF1Q15637 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF1Q15637 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF1Q15637 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF1Q15637 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SF1Q15637 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF1Q15637 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF1Q15637 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF1Q15637 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF1Q15637 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF1Q15637 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SF1Q15637 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF1Q15637 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF1Q15637 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF1Q15637 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF1Q15637 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF1Q15637 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF1Q15637 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SF1Q15637 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF1Q15637 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF1Q15637 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF1Q15637 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF1Q15637 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF1Q15637 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF1Q15637 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF1Q15637 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF1Q15637 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF1Q15637 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF1Q15637 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF1Q15637 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF1Q15637 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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