Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYTH1Q15438 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYTH1Q15438 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH1Q15438 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH1Q15438 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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