Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CYTH1Q15438 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CYTH1Q15438 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CYTH1Q15438 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CYTH1Q15438 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CYTH1Q15438 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CYTH1Q15438 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CYTH1Q15438 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CYTH1Q15438 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CYTH1Q15438 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CYTH1Q15438 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CYTH1Q15438 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CYTH1Q15438 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CYTH1Q15438 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CYTH1Q15438 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CYTH1Q15438 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CYTH1Q15438 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CYTH1Q15438 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CYTH1Q15438 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CYTH1Q15438 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CYTH1Q15438 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CYTH1Q15438 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CYTH1Q15438 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CYTH1Q15438 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CYTH1Q15438 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CYTH1Q15438 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CYTH1Q15438 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CYTH1Q15438 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CYTH1Q15438 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CYTH1Q15438 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CYTH1Q15438 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CYTH1Q15438 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CYTH1Q15438 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CYTH1Q15438 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CYTH1Q15438 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CYTH1Q15438 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CYTH1Q15438 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CYTH1Q15438 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CYTH1Q15438 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CYTH1Q15438 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CYTH1Q15438 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CYTH1Q15438 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CYTH1Q15438 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CYTH1Q15438 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CYTH1Q15438 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CYTH1Q15438 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CYTH1Q15438 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CYTH1Q15438 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CYTH1Q15438 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CYTH1Q15438 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CYTH1Q15438 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CYTH1Q15438 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CYTH1Q15438 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CYTH1Q15438 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CYTH1Q15438 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CYTH1Q15438 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CYTH1Q15438 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CYTH1Q15438 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CYTH1Q15438 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CYTH1Q15438 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CYTH1Q15438 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CYTH1Q15438 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CYTH1Q15438 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CYTH1Q15438 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CYTH1Q15438 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CYTH1Q15438 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CYTH1Q15438 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CYTH1Q15438 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CYTH1Q15438 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CYTH1Q15438 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CYTH1Q15438 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CYTH1Q15438 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CYTH1Q15438 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CYTH1Q15438 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CYTH1Q15438 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CYTH1Q15438 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CYTH1Q15438 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CYTH1Q15438 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CYTH1Q15438 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CYTH1Q15438 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CYTH1Q15438 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CYTH1Q15438 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CYTH1Q15438 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CYTH1Q15438 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CYTH1Q15438 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CYTH1Q15438 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CYTH1Q15438 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYTH1Q15438 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CYTH1Q15438 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CYTH1Q15438 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYTH1Q15438 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYTH1Q15438 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CYTH1Q15438 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CYTH1Q15438 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CYTH1Q15438 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYTH1Q15438 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CYTH1Q15438 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CYTH1Q15438 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CYTH1Q15438 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CYTH1Q15438 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms