Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf61Q13536 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf61Q13536 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf61Q13536 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf61Q13536 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf61Q13536 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf61Q13536 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf61Q13536 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
C1orf61Q13536 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms