Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TCIRG1Q13488 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TCIRG1Q13488 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TCIRG1Q13488 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
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