Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NFIAQ12857 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NFIAQ12857 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFIAQ12857 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NFIAQ12857 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
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