Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CHRNDQ07001 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHRNDQ07001 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHRNDQ07001 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHRNDQ07001 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.5 ms