Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREMQ03060 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREMQ03060 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREMQ03060 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREMQ03060 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREMQ03060 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREMQ03060 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREMQ03060 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREMQ03060 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CREMQ03060 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREMQ03060 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CREMQ03060 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREMQ03060 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREMQ03060 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREMQ03060 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREMQ03060 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREMQ03060 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CREMQ03060 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CREMQ03060 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREMQ03060 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREMQ03060 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREMQ03060 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREMQ03060 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREMQ03060 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREMQ03060 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREMQ03060 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREMQ03060 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREMQ03060 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREMQ03060 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREMQ03060 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CREMQ03060 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREMQ03060 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREMQ03060 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREMQ03060 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREMQ03060 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREMQ03060 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREMQ03060 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CREMQ03060 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CREMQ03060 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREMQ03060 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREMQ03060 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREMQ03060 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREMQ03060 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREMQ03060 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREMQ03060 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREMQ03060 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREMQ03060 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREMQ03060 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREMQ03060 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CREMQ03060 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREMQ03060 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREMQ03060 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREMQ03060 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREMQ03060 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms