Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED6P86452 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED6P86452 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZBED6P86452 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED6P86452 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms