Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNB3P54284 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CACNB3P54284 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CACNB3P54284 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNB3P54284 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 282 ms