Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
RANGAP1P46060 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
RANGAP1P46060 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
RANGAP1P46060 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
RANGAP1P46060 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RANGAP1P46060 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
RANGAP1P46060 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
RANGAP1P46060 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RANGAP1P46060 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RANGAP1P46060 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RANGAP1P46060 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
RANGAP1P46060 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RANGAP1P46060 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
RANGAP1P46060 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
RANGAP1P46060 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RANGAP1P46060 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RANGAP1P46060 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
RANGAP1P46060 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
RANGAP1P46060 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
RANGAP1P46060 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
RANGAP1P46060 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
RANGAP1P46060 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RANGAP1P46060 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RANGAP1P46060 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
RANGAP1P46060 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
RANGAP1P46060 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
RANGAP1P46060 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC40.02■■■■■ 4
RANGAP1P46060 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC40.01■■■■■ 4
RANGAP1P46060 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
RANGAP1P46060 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
RANGAP1P46060 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
RANGAP1P46060 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC40■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
RANGAP1P46060 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC39.92■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
RANGAP1P46060 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.83■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
RANGAP1P46060 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
RANGAP1P46060 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms