Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOLR3P41439 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOLR3P41439 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOLR3P41439 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOLR3P41439 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms