Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FLT4P35916 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FLT4P35916 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FLT4P35916 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FLT4P35916 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FLT4P35916 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FLT4P35916 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FLT4P35916 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FLT4P35916 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FLT4P35916 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FLT4P35916 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
FLT4P35916 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
FLT4P35916 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FLT4P35916 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FLT4P35916 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FLT4P35916 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FLT4P35916 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FLT4P35916 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FLT4P35916 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
FLT4P35916 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FLT4P35916 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FLT4P35916 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FLT4P35916 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FLT4P35916 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FLT4P35916 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FLT4P35916 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
FLT4P35916 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FLT4P35916 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FLT4P35916 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
FLT4P35916 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
FLT4P35916 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
FLT4P35916 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
FLT4P35916 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
FLT4P35916 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FLT4P35916 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FLT4P35916 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
FLT4P35916 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FLT4P35916 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FLT4P35916 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FLT4P35916 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
FLT4P35916 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FLT4P35916 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FLT4P35916 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FLT4P35916 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FLT4P35916 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
FLT4P35916 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FLT4P35916 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FLT4P35916 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FLT4P35916 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FLT4P35916 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FLT4P35916 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FLT4P35916 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FLT4P35916 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FLT4P35916 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
FLT4P35916 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FLT4P35916 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FLT4P35916 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FLT4P35916 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FLT4P35916 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
FLT4P35916 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
FLT4P35916 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
FLT4P35916 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
FLT4P35916 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FLT4P35916 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FLT4P35916 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FLT4P35916 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FLT4P35916 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FLT4P35916 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FLT4P35916 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FLT4P35916 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FLT4P35916 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FLT4P35916 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FLT4P35916 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FLT4P35916 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FLT4P35916 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FLT4P35916 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FLT4P35916 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FLT4P35916 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FLT4P35916 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FLT4P35916 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FLT4P35916 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FLT4P35916 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FLT4P35916 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FLT4P35916 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FLT4P35916 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FLT4P35916 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FLT4P35916 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FLT4P35916 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FLT4P35916 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FLT4P35916 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FLT4P35916 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FLT4P35916 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FLT4P35916 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FLT4P35916 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FLT4P35916 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
FLT4P35916 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FLT4P35916 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FLT4P35916 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FLT4P35916 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FLT4P35916 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms